〇　特別史跡「五稜郭」の土塁の形の中心に、養護学校の頭文字、ローマ字の「Ｙ」を置いた。

〇　「Ｙ」の字は、人間性豊かな子どもを育てるために調和的な発達を願う「知・徳・体」の三つの柱で、それぞれの柱はペン先を型どってあり、治療と勉強に励む児童生徒の姿を表している。

〇　学校の教育活動を通じて行われる健康回復への願いを百年以上たって、今なおがっちりとしている。 

〇　「五稜郭の土塁」に寄せており、この土塁が力強く三つの柱を支え、温かく包んでいる。

〇　校章の図案は、本校元教諭谷口幸一氏の考案によるものである。